Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptpn4Q9WU22 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn4Q9WU22 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn4Q9WU22 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptpn4Q9WU22 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptpn4Q9WU22 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptpn4Q9WU22 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms