Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psma1Q9R1P4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psma1Q9R1P4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma1Q9R1P4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms