Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp21Q9QZL6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp21Q9QZL6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp21Q9QZL6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp21Q9QZL6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp21Q9QZL6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp21Q9QZL6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms