Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1aQ9QYR6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Map1aQ9QYR6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Map1aQ9QYR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Map1aQ9QYR6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Map1aQ9QYR6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Map1aQ9QYR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Map1aQ9QYR6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Map1aQ9QYR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Map1aQ9QYR6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Map1aQ9QYR6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms