Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp1Q9QY53 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp1Q9QY53 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms