Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp3a41aQ9JMA7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms