Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc4apQ9JLV2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc4apQ9JLV2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms