Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prg3Q9JL95 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prg3Q9JL95 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prg3Q9JL95 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prg3Q9JL95 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms