Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Habp4Q9JKS5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Habp4Q9JKS5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Habp4Q9JKS5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms