Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ldb3Q9JKS4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms