Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL1

Prokr1, Prokineticin receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prokr1Q9JKL1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prokr1Q9JKL1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prokr1Q9JKL1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prokr1Q9JKL1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 637.2 ms