Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caln1Q9JJG7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Caln1Q9JJG7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Caln1Q9JJG7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caln1Q9JJG7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms