Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc86Q9JJ89 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc86Q9JJ89 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc86Q9JJ89 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms