Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc40a1Q9JHI9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc40a1Q9JHI9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc40a1Q9JHI9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms