Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr61Q9ERF3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr61Q9ERF3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr61Q9ERF3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms