Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndst3Q9EQH7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndst3Q9EQH7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms