Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlr1Q9EPQ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlr1Q9EPQ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms