Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCV7

Krt7, Keratin, type II cytoskeletal 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt7Q9DCV7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt7Q9DCV7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt7Q9DCV7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt7Q9DCV7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms