Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT9

Dmgdh, Dimethylglycine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmgdhQ9DBT9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DmgdhQ9DBT9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DmgdhQ9DBT9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DmgdhQ9DBT9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DmgdhQ9DBT9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms