Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR7

Ppp1r12a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12aQ9DBR7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1r12aQ9DBR7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms