Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Xrn2Q9DBR1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Xrn2Q9DBR1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Xrn2Q9DBR1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Xrn2Q9DBR1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrn2Q9DBR1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Xrn2Q9DBR1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms