Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med27Q9DB40 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms