Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp12Q9D9M2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp12Q9D9M2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp12Q9D9M2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms