Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcfc2Q9D968 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms