Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec11cQ9D8V7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec11cQ9D8V7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec11cQ9D8V7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sec11cQ9D8V7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec11cQ9D8V7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec11cQ9D8V7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sec11cQ9D8V7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sec11cQ9D8V7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sec11cQ9D8V7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec11cQ9D8V7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec11cQ9D8V7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec11cQ9D8V7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms