Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tvp23bQ9D8T4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tvp23bQ9D8T4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 816.1 ms