Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms