Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp4bQ9D8B3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp4bQ9D8B3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp4bQ9D8B3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms