Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnbd2Q9D5U8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnbd2Q9D5U8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms