Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Speer4f1Q9D5Q6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Speer4f1Q9D5Q6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4f1Q9D5Q6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms