Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn11Q9D572 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn11Q9D572 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn11Q9D572 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms