Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3404Q9D506 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3404Q9D506 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3404Q9D506 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239 ms