Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrnp35Q9D384 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrnp35Q9D384 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrnp35Q9D384 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp35Q9D384 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snrnp35Q9D384 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp35Q9D384 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms