Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cthrc1Q9D1D6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms