Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbed3Q9D0L1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed3Q9D0L1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zbed3Q9D0L1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms