Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms