Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem39aQ9CYC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem39aQ9CYC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39aQ9CYC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms