Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl11Q9CXW4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl11Q9CXW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms