Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms