Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pop4Q9CR08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pop4Q9CR08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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