Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifitm3Q9CQW9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms