Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Npm3Q9CPP0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npm3Q9CPP0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms