Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt23Q99PS0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt23Q99PS0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt23Q99PS0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms