Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NsmfQ99NF2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NsmfQ99NF2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NsmfQ99NF2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms