Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Atoh8Q99NA2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atoh8Q99NA2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atoh8Q99NA2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms