Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Brms1Q99N20 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brms1Q99N20 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1Q99N20 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms