Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a8Q99N10 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a8Q99N10 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms