Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC9

Pex6, Peroxisome assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex6Q99LC9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex6Q99LC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pex6Q99LC9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex6Q99LC9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms