Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pagr1aQ99L02 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pagr1aQ99L02 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms