Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dok4Q99KE3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dok4Q99KE3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.8 ms